1994年集中归并了原分散在二局一、二、三、四队和地质矿产研究所的主要地勘技术人员、地质资料-矿权资产，组建“冶金工业部第二地质勘查局地质矿产开发院 ”，院部设在原“冶金工业部地质勘查总局二局地质矿产研究所”所在地：福建莆田市涵江区。

      2001年初，单位名称变更为“中国冶金地质勘查工程总局第二地质勘查院”；

      2006年8月，经国务院国资委批准，“中国冶金地质勘查工程总局”更名为“中国冶金地质总局”，我院作为下属单位名称相应变更为“中国冶金地质总局第二地质勘查院”。